Genetic diversity of Rhizoctonia cerealis isolates from western Poland
Zróżnicowanie genetyczne izolatów Rhizoctonia cerealis pochodzących z zachodniej Polski
Ilona Świerczyńska, e-mail: i.swierczynska@iorpib.poznan.pl
Instytut Ochrony Roślin – Państwowy Instytut Badawczy Zakład Mikologii , Władysława Węgorka 20, 60-318 Poznań , PolskaKatarzyna Pieczul
Instytut Ochrony Roślin – Państwowy Instytut Badawczy Zakład Mikologii , Władysława Węgorka 20, 60-318 Poznań, PolskaAbstract |
Rhizoctonia cerealis cause sharp eyespot, a common disease of cereals in Poland. The study was aimed at assessing the level of genetic diversity of R. cerealis isolates from the Wielkopolska region using RAPD (random amplification of polymorphic DNA) method. All isolates were identified by staining of nucleus in hyphal cells with a safranin solution. Genomic DNA (deoxyribonucleic acid) was extracted from fresh mycelium growing on NB (nutrient broth) liquid medium. The PCR (polymerase chain reaction) reaction was carried out using a series of RAPD primers. The isolates showed high level of genetic diversity. There was no correlation between the host plant, a place of origin of the isolates studied, and their RAPD profiles.
Rhizoctonia cerealis powoduje ostrą plamistość oczkową, powszechną w Polsce chorobę podstawy źdźbła zbóż. Przeprowadzone badania miały na celu poznanie zróżnicowania genetycznego izolatów R. cerealis pochodzących z terenu Wielkopolski za pomocą metody RAPD (random amplification of polymorphic DNA). Izolaty zostały zidentyfikowane na podstawie wybarwiania jąder komórkowych safraniną. Izolację DNA (deoxyribonucleic acid) przeprowadzono z grzybni rosnącej na pożywce NB (nutrient broth). Reakcję PCR (polymerase chain reaction) przeprowadzono z wykorzystaniem szeregu starterów RAPD. Badane izolaty wykazały wysoki poziom zróżnicowania genetycznego badanych izolatów. Nie stwierdzono korelacji pomiędzy rośliną żywicielską i miejscem pochodzenia izolatów a i ich profilami RAPD. |
Key words |
sharp eyespot; Rhizoctonia cerealis; genetic diversity; RAPD; ostra plamistość oczkowa; zróżnicowanie genetyczne |
Progress in Plant Protection (2012) 52: 784-787 |
First published on-line: 2012-12-30 00:00:00 |
http://dx.doi.org/10.14199/ppp-2012-135 |
Full text (.PDF) BibTeX Mendeley Back to list |