@Articles{,
    	author	 = {Natasza Borodynko and Małgorzata Jeżewska},
    	title 	 = {{Development of reverse-transcription loop-mediated isothermal amplification assay (RT-LAMP) for the detection of Barley yellow mosaic virusOpracowanie metody odwrotnej transkrypcji i izotermalnej amplifikacji DNA z zastosowaniem starterów zapętlających (RT-LAMP) do wykrywania wirusa żółtej mozaiki jęczmienia  (Barley yellow mosaic virus)}},
    	journal  = {Progress in Plant Protection},
    	year	 = {2015},
    	volume   = {55},
    	number   = {3},
		pages    = {346-351},
    	abstract = {Barley yellow mosaic virus (BaYMV) is the causal agent of a dangerous disease of winter barley, identified in Poland for the first time in 2008. It is transmitted by a root-inhabiting fungal-like plasmodiophorid Polymyxa graminis Led, and thus the disease is called “soil-borne”. Taking into account the way of transmission of the pathogen, the only method of protection of winter barley crops against this pathogen is breeding and cultivation of resistant/tolerant cultivars. The objective of investigations presented in this paper was to develop an improved efficient diagnostic molecular method for precise detection of BaYMV in assessed materials. For the first time a reverse-transcription loop-mediated isothermal amplification assay (RT-LAMP) was chosen and adopted for improved diagnostics of BaYMV. The specific RT-LAMP primers for BaYMV detection were designed based on the coat protein gene. RT-LAMP assay is inexpensive and easy to perform, so it may be used for the rapid and specific diagnosis of BaYMV. Wirus żółtej mozaiki jęczmienia (Barley yellow mosaic virus, BaYMV) jest sprawcą niebezpiecznej choroby jęczmienia ozimego. W Polsce po raz pierwszy został zidentyfikowany w 2008 roku. BaYMV jest przenoszony przez pierwotniaka glebowego Polymyxa graminis Led. i dlatego wiroza określana jest jako „odglebowa”, a jedynym sposobem jej zwalczania pozostaje hodowla i uprawa odmian odpornych/tolerancyjnych. Celem badań było opracowanie bardziej czułych, molekularnych metod diagnostycznych, pozwalających na precyzyjną ocenę porażeń roślin przez wirus. Po raz pierwszy zaadaptowano molekularną technikę odwrotnej transkrypcji i izotermicznej amplifikacji DNA z zastosowaniem starterów zapętlających (RT-LAMP – reverse-transcription loop-mediated isothermal amplification assay) i wykazano możliwość jej wykorzystania w diagnostyce BaYMV. Specyficzne startery zaprojektowano w oparciu o sekwencję nukleotydów genu kodującego białko płaszcza. RT-LAMP ze względu na niskie koszty wykonania, jak i szybkość reakcji może być wykorzystywany do szybkiej i specyficznej diagnostyki wirusa.},
		affiliation = {Instytut Ochrony Roślin-PIB, Władysława Węgorka 20, 60-318 Poznań, Polska, Instytut Ochrony Roślin-PIB, Władysława Węgorka 20, 60-318 Poznań, Polska},
		keywords = {<em><span>Barley yellow mosaic virus</span></em><span>, winter barley, diagnostics, RT-LAMP,  <span>wirus żółtej mozaiki jęczmienia, jęczmień ozimy, diagnostyka</span></span>},
    	url 	 = {https://www.progress.plantprotection.pl:443/?node_id=35&ma_id=1390}
    }