@Articles{,
    	author	 = {Beata Hasiów-Jaroszewska and Daria Budzyńska and Julia Minicka and Natasza Borodynko-Filas},
    	title 	 = {{Use of qRT-PCR assay with TaqMan probe for simultaneous detection of various Pepino mosaic virus (PepMV) strains in infected plantsZastosowanie techniki qRT-PCR z sondą TaqMan do jednoczesnego wykrywania różnych szczepów wirusa mozaiki pepino (Pepino mosaic virus, PepMV) w porażonych roślinach}},
    	journal  = {Progress in Plant Protection},
    	year	 = {2018},
    	volume   = {58},
    	number   = {3},
		pages    = {193-197},
    	abstract = {Pepino mosaic virus (PepMV) has been a serious threat to greenhouse tomato production for many years. So far, five PepMV strains have been distinguished: European (EU), Peruvian (LP), southern Peruvian (PES), American 1 (US1) and Chilean 2 (CH2), the latter dominating in Europe. The occurrence of mixed infections with two different strains (combinations of EU and CH2) has also been observed. During 2016–2017, 71 tomato samples were analyzed for the presence of PepMV at the Plant Disease Clinic Institute of Plant Protection – National Research Institute. The conventional reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) and quantitative RT-PCR (qRT-PCR) with TaqMan probe were used. The presence of PepMV was confirmed in 23 samples, however, the use of qRT-PCR allowed additional detection of a mixed infection of EU/CH2 strains in 3 samples. Thus, the qRT-PCR technique can be used to verify the presence of various PepMV strains in our country. Wirus mozaiki pepino (Pepino mosaic virus, PepMV) od wielu lat stanowi poważne zagrożenie w uprawie pomidora szklarniowego. Do tej pory w populacji wirusa wyróżniono pięć szczepów: europejski (EU), peruwiański (LP), południowo-peruwiański (PES), amerykański 1 (US1) oraz chilijski 2 (CH2), z których ten ostatni dominuje w Europie. W wielu europejskich krajach stwierdzono również występowanie mieszanych infekcji szczepów EU/CH2. W latach 2016–2017 w Klinice Chorób Roślin Instytutu Ochrony Roślin – Państwowego Instytutu Badawczego przebadano 71 próbek roślin pomidora na obecność PepMV. Próbki analizowano za pomocą konwencjonalnej techniki odwrotnej transkrypcji i łańcuchowej reakcji polimerazy (RT-PCR) oraz w czasie rzeczywistym z wykorzystaniem sondy typu TaqMan (qRT-PCR). W obu przypadkach potwierdzono obecność PepMV w 23 próbkach, a zastosowanie qRT-PCR umożliwiło dodatkowo wykrycie mieszanej infekcji szczepów EU/CH2 w 3 próbkach. Technika qRT-PCR może być więc stosowana do weryfikacji obecności różnych szczepów PepMV na terenie naszego kraju.},
		affiliation = {Instytut Ochrony Roślin – Państwowy Instytut Badawczy, Władysława Węgorka 20, 60-318 Poznań, Polska, Instytut Ochrony Roślin – Państwowy Instytut Badawczy, Władysława Węgorka 20, 60-318 Poznań, Polska, Instytut Ochrony Roślin – Państwowy Instytut Badawczy, Władysława Węgorka 20, 60-318 Poznań, Polska, Instytut Ochrony Roślin – Państwowy Instytut Badawczy, Władysława Węgorka 20, 60-318 Poznań, Polska},
		keywords = {<span>PepMV, strains, qRT-PCR, detection, <span>szczepy, wykrywanie</span></span>},
    	url 	 = {https://www.progress.plantprotection.pl:443/?node_id=35&ma_id=2754}
    }