@Articles{,
    	author	 = {Marta Budziszewska},
    	title 	 = {{Zastosowanie techniki odwrotnej transkrypcji i kropelkowo-cyfrowego PCR (RT-ddPCR) do detekcji wirusa nekrozy pomidora (Tomato torrado virus, ToTV) w mączliku szklarniowymApplication of reverse transcription and droplet digital PCR (RT-ddPCR) for detection of tomato torrado virus (ToTV) in greenhouse whitefly}},
    	journal  = {Progress in Plant Protection},
    	year	 = {2021},
    	volume   = {61},
    	number   = {4},
		pages    = {359-364},
    	abstract = {Metoda kropelkowo-cyfrowego PCR należy do technologii amplifikacji kwasów nukleinowych trzeciej generacji, znajdując coraz częściej zastosowanie w diagnostyce fitopatogenów m.in. bakterii, nicieni, grzybów oraz wirusów. Ze względu na wysoką czułość, precyzję oraz brak konieczności stosowania krzywych standardowych i/lub genów referencyjnych stanowi doskonałą alternatywę dla łańcuchowej reakcji polimerazy PCR w czasie rzeczywistym. Niniejsza praca przedstawia możliwość zastosowania techniki odwrotnej transkrypcji i ddPCR (RT-ddPCR) do detekcji wirusa nekrozy pomidora (ToTV) w mączliku szklarniowym (Trialeurodes vaporariorum), który stanowi realne źródło zagrożenia dla upraw pomidora, szczególnie w krajach Europy południowej, gdzie obserwowane jest nasilone występowanie tego wirusa. Przeprowadzona na matrycy cDNA ocena ilości kopii wirusowego RNA w pojedynczym dorosłym osobniku mączlika szklarniowego wykazała, że może on nieść od 220 do nawet 8600 kopii badanego genu wirusa. Ze względu na brak skutecznych środków przeciwwirusowych, nowoczesne i szybkie techniki detekcji wirusów w roślinach, czy ich wektorach, są istotą walki z rozprzestrzenianiem chorób wirusowych. Opracowany protokół RT-ddPCR do detekcji ToTV w mączlikach może stanowić skuteczne narzędzie do monitorowania realnego zagrożenia chorobą pomidorów określaną przez hiszpańskich farmerów mianem „torrao”. The technology of droplet digital PCR is considered to be third-generation technology of nucleic acid amplification recently developed for the diagnostics of phytopathogens, such as bacteria, nematodes, fungi and viruses. Due to its high sensitivity, precision and no need to use standard curves and/or reference genes it is an alternative to a real-time polymerase chain reaction (RT-qPCR). This paper presents the possibility of using the reverse transcription technique followed by ddPCR (RT-ddPCR) to detect tomato torrado virus, ToTV in the greenhouse whitefly (Trialeurodes vaporariorum), which is a real source of ToTV in tomato cultivation, especially in southern European countries, where it’s increased occurrence has been observed. The analysis of cDNA template evaluation of the virus RNA copies in a single adult greenhouse whitefly showed that it could carry from 220 to even 8600 copies of the virus gene. Due to the lack of effective antiviral agents, innovative and rapid viruses diagnostic assays are the essence of the fight against development of viral diseases. Therfore reported here RT-ddPCR protocol for the detection of ToTV in whiteflies may be an effective tool for monitoring the real threat of the tomato disease described by Spanish farmers as ”torrao”.},
		affiliation = {Instytut Ochrony Roślin – Państwowy Instytut Badawczy, Władysława Węgorka 20, 60-318  Poznań, Polska},
		keywords = {kropelkowo-cyfrowy PCR, ekspresja absolutna, diagnostyka wirusa nekrozy pomidora, mączlik szklarniowy, transmisja wirusa, wektor owadzi, droplet digital PCR, absolute quantification, tomato torrado virus detection, greenhouse whitefly, virus transmission, insect vector},
    	url 	 = {https://www.progress.plantprotection.pl:443/?node_id=35&ma_id=4415}
    }